Epidemiología genética de las enfermedades gastrointestinales de carácter Inflamatorio y neoplásico
Grupos de investigación
La inclusión de scores genéticos en los modelos de predicción de riesgo y pronóstico de neoplasias del tracto digestivo puede mejorar significativamente la capacidad discriminativa de dichos modelos
Equipo Científico
INVESTIGADOR PRINCIPAL
EQUIPO
Mark Strunk
Patricia Carrera Lasfuentes
Samantha Arechavaleta Tabuenca
Investigadores asociados:
Federico Sopeña, Carla Gargallo, Rafael Benito, Vega Rodrigálvarez, Rocío Aznar, Rafael del Hoyo, Luis Bujanda, Enrique Quintero, Mª Ángeles Pérez Aísa, Leticia Moreira, Koldo García, David Nicolás, Johannes Schumacher, Timo Hess.
Actividad del grupo de investigación
La investigación en epidemiología genética de patologías complejas se centra en la identificación de variantes genéticas de riesgo asociadas al desarrollo de enfermedades y al estudio de las interacciones con factores ambientales. El principal objetivo de los estudios de asociación es el hallazgo de marcadores de riesgo y/o pronóstico que permitan identificar qué poblaciones de individuos tienen más posibilidades de desarrollar una determinada patología o presentar un peor pronóstico en su evolución y puedan beneficiarse, por tanto, de medidas preventivas y terapéuticas personalizadas.
Nuestro grupo trabaja en estrecha relación con un equipo multidisciplinar formado por clínicos, investigadores básicos y bioinformáticos de diversos centros nacionales e
internacionales cuyo trabajo conjunto y sostenido a lo largo de los años ha permitido abordar desde el punto de vista de la epidemiología genética, patologías tan complejas y multifactoriales como son las enfermedades asociadas a la infección por Helicobacter pylori (úlcera péptica, gastritis crónica, cáncer de estómago), el cáncer de colon, la acalasia, del esófago de Barrett o la hemorragia digestiva aguda.
Centro
Programas
Digestivo
Líneas de investigación
Artículos publicados
Vacío
2022
Gargallo-Puyuelo CJ, Aznar-Gimeno R, Carrera-Lasfuentes P, Lanas Á, Ferrández Á, Quintero E, Carrillo M, Alonso-Abreu I, Esteban LM, de la Vega Rodrigálvarez-Chamarro M, Del Hoyo-Alonso R, García-González MA. Predictive Value of Genetic Risk Scores in the Development of Colorectal Adenomas. Dig Dis Sci. 67
(8); 4049-4058 (2022). PMID: 34387810. DOI: 10.1007/s10620-021-07218-5.
2021
Gargallo-Puyuelo CJ, Lanas Á, Carrera-Lasfuentes P, Ferrández Á, Quintero E, Carrillo M, Alonso-Abreu I, García-González MA. Familial colorectal cancer and genetic susceptibility: Colorectal risk variants in first-degree relatives of patients with colorectal cancer. Clin Transl Gastroenterol. 12:e00301 (2021). PMID: 33534415. DOI: 10.14309/ctg.0000000000000301.
Gargallo-Puyuelo CJ, Aznar-Gimeno R, Carrera-Lasfuentes P, Lanas Á, Ferrández Á, Quintero E, Carrillo M, Alonso-Abreu I, Esteban LM, de la Vega Rodrigálvarez-Chamarro M, Del Hoyo-Alonso R, García-González MA. Predictive Value of Genetic Risk Scores in the Development of Colorectal Adenomas. Dig Dis Sci. (2021) (Online ahead of print). PMID: 34387810. DOI: 10.1007/s10620-021-07218-5.
2017-2020
2020
Gargallo-Puyuelo CJ, Lanas Á, Carrera-Lasfuentes P, Ferrández Á, Quintero E, Carrillo M, Alonso-Abreu I, García-González MA. Familial colorectal cancer and genetic susceptibility: Colorectal risk variants in first-degree relatives of patients with colorectal cancer. Clin Transl Gastroenterol. 12:e00301 (2020). PMID: 33534415.
Chueca E, Valero A, Hördnler C, Puertas A, Carrera P, García-González MA, Strunk M, Lanas A, Piazuelo E. Quantitative analysis of p16 methylation in Barrett’s carcinogenesis. Ann Diagn Pathol. 47:151554. (2020) PMID: 32570024.
2019
Carriazo S P-G, M. V.;Cordido, A.;Garcia-Gonzalez, M. A.;Sanz, A. B.;Ortiz, A.;Sanchez-Nino, M. D. Dietary Care for ADPKD Patients: Current Status and Future Directions. Nutrients 2019; 11(7). DOI 10.3390/nu11071576. ISSN:2072-6643
Gargallo C J L, A.;Carrera-Lasfuentes, P.;Ferrandez, A.;Quintero, E.;Carrillo, M.;Alonso-Abreu, I.;Garcia-Gonzalez, M. A. Genetic susceptibility in the development of colorectal adenomas according to family history of colorectal cancer. Int J Cancer 2019; 144 (3):489-502. DOI 10.1002/ijc.31858. ISSN: 0020-7136
2018
Heinrichs SKM, Hess T, Becker J, Hamann L, Vashist YK, Butterbach K, Schmidt T, Alakus H, Krasniuk I, Höblinger A, Lingohr P, Ludwig M, Hagel AF, Schildberg CW, Veits L, Gyvyte U, Weise K, Schüller V, Böhmer AC, Schröder J, Gehlen J, Kreuser N, Hofer S, Lang H, Lordick F, Malfertheiner P, Moehler M, Pech O, Vassos N, Rodermann E, Izbicki JR, Kruschewski M, Ott K, Schumann RR, Vieth M, Mangold E, Gasenko E, Kupcinskas L, Brenner H, Grimminger P, Bujanda L, Sopeña F, Espinel J, Thomson C, Pérez-Aísa Á, Campo R, Geijo F, Collette D, Bruns C, Messerle K, Gockel I, Nöthen MM, Lippert H, Ridwelski K, Lanas A, Keller G, Knapp M, Leja M, Kupcinskas J, García-González MA, Venerito M, Schumacher J.
Heinrichs, Hess, Leja, Kupcinskas, García-González, Venerito and Schumacher authors contributed equally to this work.
Evidence for PTGER4, PSCA and MBOAT7 as risk genes for gastric cancer on the genome and transcriptome level. Cancer Med 2018; 7:5057-65.
2017
a) Carrera-Lasfuentes P, Lanas A, Bujanda L, Strunk M, Quintero E, Santolaria S, Benito R, Sopeña F, Piazuelo E, Thomson C, Pérez-Aísa A, Nicolás-Pérez D, Hijona E, Espinel J, Campo R, Manzano M, Geijo F, Pellisé M, Zaballa M, González-Huix F, Espinós J, Titó Ll, Barranco L, D´Amato M, García-González MA. Relevance of DNA repair gene polymorphisms on gastric cancer risk and phenotype. Oncotarget 2017; 8:35848-62.
Factor impacto: 5.008 (WOS 2016)
Subject categories: ONCOLOGY Posición: 36/213 Cuartil: 1
Subject categories: CELL BIOLOGY Posición: 43/187 Cuartil: 1
b) Jiménez P, Chueca E, Arruebo M, Strunk M, Solanas E, Serrano T, García-González MA, Lanas A. Proton Pump Inhibitors Display Antitumor Effects in Barrett’s Adenocarcinoma Cells. Pharmacol 2017; 8:321 doi: 10.3389/fphar.2017.00321. eCollection.
Factor impacto: 4.400
Subject categories: PHARMACOLOGY & PHARMACY. Posición: 33/255. Cuartil: 1
c) Gargallo CJ, Lanas A, Carrera-Lasfuentes P, Ferrández A., Quintero E., Carrillo M, Alonso-Abreu I, García-González MA. Influence of family history of colorectal cancer in the genetic susceptibility to colorectal adenomas development. Enviado a GUT referencia número: gutjnl-2017-315461.
d) Schumacher J; Heinrichs S; Hess T; Becker J; Hamann L; Vashist Y; Butterbach; Schmidt T; Alakus H; Krasniuk I; Höblinger A; Lingohr P; Ludwig M; Hagel A; Schildberg C; Veits L; Gyvyte U; Schüller V; Böhmer A; Schröder J; Gehlen J; Kreuser N; Lang H; Lordick F; Malfertheiner P; Moehler M; Pech O; Vassos N; Rodermann E; Izbicki A; Kruschewski M; Ott K; Schumann R; Vieth M; Mangold E; Gasenko E; Kupcinskas L; Brenner H; Grimminger P; Bujanda L; Sopena F; Espinel J; Thomson C; Perez-Aisa A; Campo R; Geijo F; Collette D; Bruns C; Gockel I; Nöthen M; Lippert H; Ridwelski K; Lanas A; Keller G; Knapp M; Leja M; Kupcinskas J; Garcia-Gonzalez MA; Venerit M. Evidence for PTGER4, PSCA and MBOAT7 as risk genes for gastric cancer on the genome and transcriptome level. Enviado a Gastric Cancer, referencia número: GCAN-D-18-00113.
Proyectos activos
PROYECTOS
- GastricAITool: Early Diagnosis & Prevention of Gastric Cancer. GATEKEEPER (2 open call), European Union’s Horizon 2020 research and innovation programmeunder grant agreement Nº 857223. IPs: Mª Asunción García González y Rafael del Hoyo Alonso. (https://www.gatekeeper-project.eu). Cuantía: 100.000 €
- Proyecto FIS PI22/00537: Evaluación del riesgo y pronóstico del cáncer gástrico mediante un score genético basado en el análisis del exoma. Interacción con factores
ambientales e infección por Helicobacter pylori. IP: Mª Asunción García González. Cuantía: 171.820 € - European staR project on gastric cancer research (https://www.star-project.md). Mª Asunción García González. Investigadora Senior IACS. Miembro del grupo de Investigación Traslacional en Patología Digestiva de la DGA (Ref: B25_17R), del IIS Aragón (Ref: GIIS 27) y del CIBER de enfermedades hepáticas y digestivas (CIBERehd).
Actividad y resultados más relevantes del año
Desde el año 2005 nuestro grupo coordina un estudio nacional multicéntrico cuyo objetivo principal es la identificación de factores de riesgo (ambientales y genéticos) asociados con el cáncer de estómago en España. El cáncer de estómago es la quinta neoplasia más frecuente y representa la tercera causa de muerte por cáncer en el mundo. Cuando un médico debe valorar la probabilidad de que un paciente desarrolle dicha neoplasia sabe que entran en juego muchos factores asociados como son la infección por Helicobacter pylori, la existencia de antecedentes familiares, el tabaquismo, la edad avanzada, el sexo masculino, determinados factores genéticos, etc.
El estudio de la influencia y grado de asociación de dichos factores en el riesgo y pronóstico del cáncer gástrico representa un nuevo desafío en el área de la denominada ‘medicina personalizada y de precisión”. Gracias a la concesión del proyecto GastricAItool, perteneciente a la convocatoria GATEKEEPER 2021 y en colaboración con el grupo de “Big Data and Cognitive Systems” del Instituto Tecnológico de Aragón (ITAINNOVA), hemos desarrollado a lo largo de este año diversos modelos de predicción de riesgo y pronóstico de cáncer gástrico basados en Big Data y metodología de Inteligencia Artificial. El objetivo final es la elaboración de una herramienta digital que facilite al clínico la toma de decisiones a la hora de identificar sujetos de riesgo y estratificar con mayor precisión a los pacientes en función del pronóstico (https://www.iisaragon.es/esta-inteligencia-artificial-predice-mi-cancer-de-estomago). La ejecución del proyecto FIS PI22/00537 nos permitirá evaluar, además, el
efecto de la inclusión de un score genético basado en el análisis del exoma en los modelos de predicción de riesgo y pronóstico de cáncer gástrico. También en relación
con dicha neoplasia, hemos continuado la colaboración de nuestro grupo con el Servicio de Digestivo del HospitalClinic de Barcelona centrada en la identificación de nuevos genes implicados en el riesgo de desarrollar cáncer gástrico precoz (< 50 años) mediante la secuenciación completa del exoma (WES).
Por último, a lo largo de este año hemos finalizado el estudio de la contribución en el desarrollo de lesiones preneoplásicas de cáncer colorrectal (CCR) de un panel de SNPs asociados con riesgo de CCR. Hemos observado que la inclusión de un score de riesgo genético (GRS, del inglés genetic risk score) basado en 5 SNPs (rs10505477, rs11255841, rs13181, rs4779584 y rs8180040) asociados con CCR en los modelos de predicción de riesgo de adenomas colorrectales mejora significativamente la capacidad discriminatoria de dichos modelos en comparación con aquellos basados sólo en el sexo, la edad y la historia familiar de CCR.
Fecha actualización
Noviembre 2023